Το Μουσείο Τοπικής φυσικής ιστορίας του Γυμνασίου Γέργερης-Δήμου Ρούβα, ιδρύθηκε το 1996 μετά από μια πρωτοποριακή συνεργασία του Γυμνασίου Γέργερης (καθηγητές-μαθητές) του Δήμου Ρούβα, του ΤΟΕΒ Γέργερης και άλλων τοπικών φορέων. Επιστημονική στήριξη παρείχαν η Δνση Δασών Ηρακλείου, το ΙΓΜΕ, το Μουσείο Φυσικής Ιστορίας του Πανεπιστημίου Κρήτης και Αθήνας το ΓΕΩΤΕΕ/παρ. Κρήτης. Ακόμα υπήρξε συνεργασία με αρκετούς ιδιωτικούς φορείς.

Διευθυντής του γυμνασίου Γέργερης ήταν ο Κωνσταντίνος Καλογιαννάκης (φυσιογνώστης),
Επιστημονικός υπεύθυνος ήταν ο Στέλιος Μανωλιούδης (γεωλόγος),
Την παιδαγωγική ομάδα συμπλήρωσαν ο Γιάννης Αλεβιζάκης (μαθηματικός) και η Κατερίνα Σκαλίδη (φιλόλογος),
Επίσης συμμετείχαν το σύνολο των μαθητών του γυμνασίου Γέργερης τις σχολικές χρονιές 1995-1996 και 1996-1997.

Το Μουσείο αυτό στεγάζεται στα κτήρια του Γυμνασίου Γέργερης, σε χώρο πρώην κατασκηνώσεων (λειτουργούσαν έως το 1972), έκτασης 30 στρεμμάτων, κατάφοιτων από πεύκα.

Σκοποί του Μουσείου είναι :

• Να συμβάλλει στην καταγραφή, τη μελέτη, την ανάδειξη των στοιχείων του φυσικού περιβάλλοντος και να βοηθήσει στην ανάπτυξη της ευρύτερης περιοχής.
• Να διαδραματίσει σημαντικό ρόλο στην εκπαίδευση και ευαισθητοποίηση των νέων κυρίως αλλά και όλων μας σε θέματα περιβάλλοντος.
• Να συμβάλλει στην προστασία των απειλουμένων ειδών της περιοχής.